染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序技術(shù)

染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA互作的工具，通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的全基因組研究。這一方法將ChIP與高通量測(cè)序相結(jié)合，也就是ChIP-Seq技術(shù)。它能夠在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA。

ChIP-Seq的原理可概括為：

首先，通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段，并對(duì)其進(jìn)行純化與測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建；

然后，對(duì)富集得到的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序。將獲得的序列定位到基因組上，根據(jù)序列富集來計(jì)算出與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA信息。

實(shí)驗(yàn)流程：

（1）甲醛交聯(lián)整個(gè)細(xì)胞或組織，也可以不采用交聯(lián)的方式，這一步走將目標(biāo)蛋白與染色質(zhì)固定起來；

（2）分離細(xì)胞核，并用超聲波或者核酸酶將染色質(zhì)剪斷；

（3）與目標(biāo)蛋白質(zhì)特異的抗體孵育成復(fù)合體；

（4）去交聯(lián)或直接開展下面步驟；

（5）提取DNA，構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)；

（5）將DNA文庫(kù)樣本進(jìn)行測(cè)序。