染色質(zhì)免疫共沉淀測序技術

染色質(zhì)免疫共沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是研究細胞內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA互作的工具，通常用于轉(zhuǎn)錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的全基因組研究。這一方法將ChIP與高通量測序相結合，也就是ChIP-Seq技術。它能夠在全基因組范圍內(nèi)檢測與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA。

ChIP-Seq的原理可概括為：

首先，通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，并對其進行純化與測序文庫構建；

然后，對富集得到的DNA片段進行高通量測序。將獲得的序列定位到基因組上，根據(jù)序列富集來計算出與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA信息。

實驗流程：

（1）甲醛交聯(lián)整個細胞或組織，也可以不采用交聯(lián)的方式，這一步走將目標蛋白與染色質(zhì)固定起來；

（2）分離細胞核，并用超聲波或者核酸酶將染色質(zhì)剪斷；

（3）與目標蛋白質(zhì)特異的抗體孵育成復合體；

（4）去交聯(lián)或直接開展下面步驟；

（5）提取DNA，構建測序文庫；

（5）將DNA文庫樣本進行測序。