張建華團(tuán)隊(duì)報(bào)道水稻花器官全基因組染色質(zhì)可及性圖譜

      該研究是香港浸會(huì)大學(xué)/香港中文大學(xué)農(nóng)業(yè)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)張建華教授團(tuán)隊(duì)完成并發(fā)表于Plant Physiology 上，標(biāo)題為 "The chromatin accessibility landscape of pistils and anthers in rice"

  這一研究利用了 ATAC-seq技術(shù)，對(duì)水稻幼穗、花藥和雌蕊進(jìn)行了開放染色質(zhì)位點(diǎn)的圖譜繪制。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與花藥相比，雌蕊中具有更多的開放染色質(zhì)位點(diǎn)。幼穗的開放染色質(zhì)密度低于花藥和雌蕊。結(jié)合轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)組蛋白的 ChIP-seq分析，發(fā)現(xiàn)水稻花的開放染色質(zhì)與基因表達(dá)以及組蛋白修飾之間存在著內(nèi)在聯(lián)系。另外，建立了雌蕊中特異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，為雌蕊發(fā)育提供了一個(gè)新工具。

   研究人員通過還提出來了一種預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的策略。也建立了低溫響應(yīng)的調(diào)控元件網(wǎng)絡(luò)。為更全面的理解水稻生殖發(fā)育和低溫響應(yīng)提供了新的工具和資源。