張建華團隊報道水稻花器官全基因組染色質可及性圖譜

      該研究是香港浸會大學/香港中文大學農業(yè)生物技術國家重點實驗張建華教授團隊完成并發(fā)表于Plant Physiology 上，標題為 "The chromatin accessibility landscape of pistils and anthers in rice"

  這一研究利用了 ATAC-seq技術，對水稻幼穗、花藥和雌蕊進行了開放染色質位點的圖譜繪制。結果發(fā)現(xiàn)，與花藥相比，雌蕊中具有更多的開放染色質位點。幼穗的開放染色質密度低于花藥和雌蕊。結合轉錄組和染色質組蛋白的 ChIP-seq分析，發(fā)現(xiàn)水稻花的開放染色質與基因表達以及組蛋白修飾之間存在著內在聯(lián)系。另外，建立了雌蕊中特異表達的轉錄因子的調控網(wǎng)絡，為雌蕊發(fā)育提供了一個新工具。

   研究人員通過還提出來了一種預測轉錄因子結合位點的策略。也建立了低溫響應的調控元件網(wǎng)絡。為更全面的理解水稻生殖發(fā)育和低溫響應提供了新的工具和資源。